Riportano, infatti, uno sfondo scaccato in bianco e verde con la dicitura S.C. Quartu S. Elena e lo stemma tradizionale disegnato, questa volta, su uno scudo sannitico partito in bianco e verde. Più avanti, sempre negli anni 2000, la squadra utilizza anche un altro gagliardetto in bianco con le classiche insegne comunali in verde.